方丈室，是寺中方丈起居与理事的地方。乾隆曾西渡洛水至少林寺，即宿于此，并赋诗一首：“明日瞻中岳，今宵宿少林。心依六禅静，寺据万山深。树古风留籁，地灵夕作阴。应教半岩雨，发我夜窗吟。”乾隆十五年（公元1750年）9月30日，清高宗弘历游少林寺时即以方丈室为行宫，故又称“龙庭”。该室初建年代约为明初，经历代维修，现存建筑为清代遗物。

今室内正中置1995年少林寺建寺1500周年时信徒赠送的鸡血石“佛祖讲法”浮雕，北壁内侧置少林寺传代世系谱，东侧放置的是弥勒佛铜像，墙上挂有“佛门八大僧图”、“达摩一苇渡江图”。室内还有1980年日本赠送的铜质达摩像。

方丈室正西为方丈退居，坐北向南，面阔三间，出前廊，为硬山式建筑。方丈退居是离任后的方丈住所。退居室前有对联“少室山下禅林静，五乳峰前钟磬悠。”东寮与西寮，在方丈院东、西两侧，为方丈院的东、西厢房，各为面阔五间的硬山式出前廊建筑，是常住执事僧起居和处理佛事活动的场所。